Ratusan pedagang Pasar Kliwon Kudus menunggak pembayaran retribusi Pemakaian Kekayaan Daerah (PKD) atau sewa kios selama beberapa tahun yang nilai tunggakannya mencapai Rp 1 miliaran. berasal dari ratusan pedagang karena total pedagang di Pasar Kliwon mencapai 2.600 pedagang. Tunggakan tersebut menjadi perhatian inspektorat maupun BPK, dan mencatatnya sebagai piutang yang harus diselesaikan. Tunggakan ini tak hanya terjadi di Pasar Kliwon tetapi juga di Pasar Bitingan dan Jember.